在過(guò)去的一年中,血液蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域質(zhì)譜法(MS)、SomaScan和Olink三大技術(shù)的成熟推動(dòng)疾病研究進(jìn)入“一滴血時(shí)代”,但耀眼數(shù)據(jù)背后,研究者正陷入前所未有的技術(shù)選擇焦慮:三大主流技術(shù)平臺(tái)成本差異懸殊,功能蛋白覆蓋有什么差異?靶向與非靶向的技術(shù)路線(xiàn),疾病研究應(yīng)該選擇誰(shuí)?
青蓮百奧基于十余年技術(shù)積累,首次將最新人血漿蛋白質(zhì)譜法(MS)自建庫(kù)(QLHPP)與SomaScan、Olink靶向平臺(tái)進(jìn)行多維硬核對(duì)比,在功能蛋白檢出、疾病領(lǐng)域覆蓋等關(guān)鍵指標(biāo)上揭示顛覆性結(jié)論,助您破解血液組學(xué)研究"選擇困難癥"。
青蓮百奧最新人血漿蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)(QLHPP)基于獨(dú)家專(zhuān)利MagicOmics-DMB磁珠試劑盒進(jìn)行低豐度蛋白富集前處理,基于質(zhì)譜法(MS)使用timsTOF HT DIA 22 min檢測(cè)構(gòu)建,共收錄11012個(gè)蛋白質(zhì),覆蓋>90%人類(lèi)蛋白質(zhì)圖譜(HPA)數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的人血漿蛋白。
QLHPP與HPA數(shù)據(jù)庫(kù)收錄人血漿蛋白venn圖
HPA數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的血漿蛋白均為擁有至少2個(gè)≥9個(gè)氨基酸的非嵌套唯一映射肽的典型蛋白,擁有良好的可驗(yàn)證性。比較QLHPP、SomaScan、Olink蛋白與HPA數(shù)據(jù)庫(kù)收錄蛋白,發(fā)現(xiàn)QLHPP能夠?qū)PA數(shù)據(jù)庫(kù)實(shí)現(xiàn)最全面的覆蓋(QLHPP 92%,Somascan 76%,Olink 46%),且擁有最豐富的獨(dú)特鑒定蛋白(QLHPP 2923,Somascan 1984,Olink 715),代表其對(duì)驗(yàn)證與發(fā)現(xiàn)研究的全面兼容。
QLHPP、Somascan、Olink與HPA數(shù)據(jù)庫(kù)收錄人血漿蛋白venn圖
基于HPA數(shù)據(jù)庫(kù)血漿蛋白豐度信息,比較QLHPP、SomaScan、Olink對(duì)不同豐度的蛋白質(zhì)的覆蓋度,發(fā)現(xiàn)QLHPP能夠最全面地覆蓋血液低、中、高豐度蛋白質(zhì),代表質(zhì)譜法可對(duì)血液蛋白實(shí)現(xiàn)無(wú)偏深度檢測(cè)。
QLHPP、Somascan、Olink對(duì)HPA數(shù)據(jù)庫(kù)各豐度人血漿蛋白的覆蓋率
近期,在2024年實(shí)現(xiàn)7000+血漿蛋白質(zhì)組鑒定數(shù)突破的基礎(chǔ)上,2025年青蓮百奧血液蛋白質(zhì)組高深度“峨眉”方案(MagicOmics DMB低豐度蛋白富集+timsTOF HT/Orbitrap Astral DIA質(zhì)譜檢測(cè))人血漿樣本項(xiàng)目可穩(wěn)定鑒定5500~7500個(gè)蛋白質(zhì),為血液蛋白深度挖掘提供了良好的土壤。
COG(Clusters of Orthologous Groups)分析基于COG數(shù)據(jù)庫(kù)提供蛋白質(zhì)的功能分類(lèi)注釋。比較QLHPP、SomaScan、Olink蛋白的COG注釋?zhuān)l(fā)現(xiàn)QLHPP能夠最全面地覆蓋多數(shù)蛋白質(zhì)功能類(lèi)型。在疾病研究中,對(duì)不同信號(hào)或代謝通路的功能蛋白開(kāi)展研究,能夠反應(yīng)更具生物學(xué)意義的疾病變化,為標(biāo)志物、機(jī)制、藥靶研究提供更有力的支持。
此外,通過(guò)Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)血漿中鑒定到的蛋白質(zhì)相關(guān)的生物學(xué)途徑、疾病、分子功能等信息進(jìn)行注釋?zhuān)l(fā)現(xiàn)QLHPP也能夠最全面地覆蓋多數(shù)常見(jiàn)通路、疾病與功能。
血液蛋白與多種疾病發(fā)生發(fā)展相關(guān),囊括諸多藥物靶點(diǎn)蛋白。通過(guò)DrugBank、FDA、KEGG Drug、ChEMBL、Phenotypes數(shù)據(jù)庫(kù)的注釋信息,可以更好地了解血液蛋白與疾病的關(guān)系。比較QLHPP、SomaScan、Olink蛋白的疾病藥靶數(shù)據(jù)庫(kù)注釋?zhuān)l(fā)現(xiàn)QLHPP能夠最全面地覆蓋多個(gè)疾病藥靶數(shù)據(jù)庫(kù)。
血液不具備蛋白質(zhì)合成功能,血液中的蛋白質(zhì)由身體各組織器官分泌釋放而來(lái),因此組織器官溯源對(duì)血液蛋白質(zhì)組研究具有重要意義,能夠支持對(duì)不同部位起源疾病及并發(fā)癥的精準(zhǔn)解析。使用HPA數(shù)據(jù)庫(kù)的人類(lèi)正常組織器官數(shù)據(jù)對(duì)血液蛋白的組織器官來(lái)源進(jìn)行注釋?zhuān)容^QLHPP、SomaScan、Olink蛋白,發(fā)現(xiàn)QLHPP能夠最全面地覆蓋多個(gè)組織器官來(lái)源。
蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)在生物學(xué)研究中具有重要意義。比較QLHPP、SomaScan、Olink蛋白,發(fā)現(xiàn)QLHPP能夠最全面地覆蓋細(xì)胞核、細(xì)胞質(zhì)來(lái)源蛋白,表明質(zhì)譜法能夠深入覆蓋來(lái)源于細(xì)胞內(nèi)、細(xì)胞核的低豐度蛋白,探索信號(hào)通路變化,助力進(jìn)一步的疾病機(jī)制與藥物靶點(diǎn)研究。
隨著檢測(cè)技術(shù)的成熟,針對(duì)血漿蛋白的研究日漸深入,豐富的血漿蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)可以獲得有關(guān)疾病、衰老過(guò)程以及疾病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)的新見(jiàn)解。
血漿蛋白質(zhì)組檢出量逐年提升
血漿蛋白質(zhì)組深度提升助力更多領(lǐng)域研究
針對(duì)血漿蛋白質(zhì)組低豐度蛋白檢測(cè)難點(diǎn),青蓮百奧提供獨(dú)家專(zhuān)利產(chǎn)品低豐度蛋白富集磁珠試劑盒(MagicOmics DMB),結(jié)合自動(dòng)化樣本前處理機(jī)器人(MagicOmics-AP-96-Pro)與timsTOF HT/Orbitrap Astral先進(jìn)質(zhì)譜平臺(tái),可實(shí)現(xiàn)高通量血漿蛋白質(zhì)組樣本標(biāo)準(zhǔn)化制備與高深度檢測(cè),輕松承接大隊(duì)列血漿標(biāo)志物研究項(xiàng)目。
對(duì)于100例以上人血漿樣本,按照推薦流程標(biāo)準(zhǔn)化采集、質(zhì)檢合格并執(zhí)行高深度峨眉方案(MagicOmics DMB低豐度蛋白富集+timsTOF HT/Orbitrap Astral DIA質(zhì)譜檢測(cè)),青蓮百奧承諾蛋白鑒定數(shù)5000+!
步驟雖繁必不敢省人工,試劑雖貴必不敢減物力,青蓮百奧助您在科研的海洋中乘風(fēng)破浪~
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